分子互作

技术服务-分子互作
Molecular interactions

RNA pull-down作为研究RNA与蛋白互作的核心技术，已成为研究焦点。RNA pull down是使用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过WB实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用，或者结合MS筛选RNA结合的未知蛋白。

RNA免疫共沉淀—RIP-seq（RNA Immunoprecipititation）是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物（RBP）沉淀下来，分离纯化捕获的RNA，结合高通量测序技术对目标RNA进行测序分析。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用，蛋白结合对象为RNA，RIP-seq即对富集得到的RNA片段进行高通量测序，是了解转录后调控网络动态过程的有力工具，能够有效探究在基因组范围内发现与蛋白或蛋白复合物相结合的RNA。

IP-MS实验（免疫沉淀-质谱）是一种结合免疫沉淀和质谱分析的技术，主要用于研究蛋白质相互作用及其复合物的组成。其基本原理是利用特异性抗体捕获目标蛋白质及其相互作用的蛋白质，然后通过质谱技术进行鉴定和定量分析。

ChIP-seq，指的是结合位点分析法，作为研究体内蛋白质与DNA相互作用。染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。

ChIP-qPCR（染色质免疫沉淀结合荧光定量PCR）技术是一种用于研究体内DNA与蛋白质相互作用的强大工具。它能够在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物，并通过特定的抗体富集目标蛋白结合的DNA片段，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。该技术在生命科学的多个领域中发挥着重要作用，包括细胞分化、肿瘤抑制基因沉默以及组蛋白修饰对基因表达的影响等。

RNA Pull Down+Seq实验是一种结合RNA Pull Down技术和高通量RNA测序（RNA-Seq）的方法，用于鉴定与特定RNA分子（如长链非编码RNA，lncRNA）直接或间接相互作用的RNA靶标。该实验的核心原理是通过RNA Pull Down技术富集目标RNA及其结合分子，随后通过RNA-Seq分析这些相互作用RNA的身份和功能。

RNA Pull Down与QPCR（定量实时PCR）结合是一种广泛应用于分子生物学研究的实验技术，主要用于研究RNA与蛋白质的相互作用及其对基因表达的调控机制。

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